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灵芝孢子是灵芝在生长成熟期，从灵芝菌褶中弹射出来的非常微小的卵形生殖细胞即灵芝的孢子。每个灵芝孢子只有4－6个微米，是活体生物体，双壁结构，外被坚硬的几丁质纤维素所包围，人体很难充分吸收。破壁后更适合人体肠胃直接吸收。
灵芝孢子粉具有灵芝的许多遗传物质，但是灵芝三萜类成分很少，用比色法测定灵芝总三萜含量该方法未测到紫芝、破壁灵芝孢子粉及未破壁灵芝孢子粉中的三萜酸，采用马林等报道的HPLC条件对于广东和福建的紫芝和孢子粉样品进行检测，结果显示，孢子粉中的三萜酸含量为ppm级，表明赤芝孢子粉中三萜酸含量很低。 其药用价值日益受到重视, 研究发现灵芝孢子具有增强机体免疫力，保护肝损伤，辐射防护作用。
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